A seguito dell'uscita della nuova versione di Ubuntu (ora alla versione 7.04) e di OpenFOAM (arrivato alla versione 1.4), vediamo come effettuare l'installazione su una macchina con il sistema operativo installato a cui non sono stati aggiunti altri pacchetti.
Come prima operazioni vanno installati alcuni pacchetti che non sono presenti nell'installazione di base di Ubuntu, in particolare è necessario installare il pacchetto per la compilazionesudo apt-get install build-essentialil server ssh necessario al programma per poter comunicare con altri eventuali macchine e comunque con se stessosudo apt-get install openssh-servered infine le librerie per l'ssl necessarie per poter eseguire l'interfaccai grafica in Java FoamX:sudo apt-get install libssl0.9.7Poiché l'installazione di OpenFOAM richiede il settaggio di alcune variabili globai che potrebbero rallentare o comunque rendere scomodo l'utilizzo quotidiano del computer per le applicazioni standard andiamo a creare un nuovo utente il cui unico scopo sarà quello di effettuare le simulazioni. Per creare un nuovo utente, da shell, diamo il seguente comandosudo adduser simulationdove con simulation abbiamo indicato il nome dell'utente che svolgerà le simulazioni. Di seguito si indicherà sempre con questo nome l'utente che svolge le simulazioni. Rispondiamo alle domande che ci vengono poste per il nuovo utente e terminiamo la creazione di questo.
Al termine della realizzazione del nuovo utente dobbiamo abilitare la possibilità di accedere tramite ssh a questo; poiché di default il server ssh richiede che il collegamente avvenga tramite protezione con certificato dobbiamo creare i certificati e esportarli. Come prima cosa diventiamo l'utente simulation con il comando su simulationed inseriamo la password che abbiamo scelto precedentemente. A questo punto creiamo le chiavi con il comandossh-keygen -t dsae lasciamola pure senza nessuna password (quindi diamo 2 volte Ok). Possiamo vedere le chiavi generare con ls .ssh/*Esportiamo ora le chiavi verso il nostro utente dando il comando:ssh-copy-id -i .ssh/id_dsa.pub vostro_utente@localhostdove, ovviamente, vostro_utente è l'utente che usate di solito sulla macchina. Alla prima richiesta digitate yes, mentre di seguito vi chiederà la password per il vostro utente. Ora possiamo uscire dall'utente simulation e tornate vostro utente, è sufficiente digitare:exitCollegiamoci ora tramite ssh all'utente simulation:ssh simulation@localhoste creaimo la direcotory dove installare OpenFOAM ed entriamoci:mkdir OpenFOAMProseguiamo con il download dei pacchetti necessari, potete scegliere se scaricarli dal sito ufficiale o direttamente dai repository, nel caso usiate una versione di linux a 32bit è sufficiente dare i comandi:
cd OpenFOAMwget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/OpenFOAM-1.4.General.gtgzuna volta terminato il download dell'ultimo pacchetto decomprimiamoli:
wget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/OpenFOAM-1.4.linuxGcc4SPOpt.gtgz
wget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/OpenFOAM-1.4.linuxGcc4DPOpt.gtgztar -xzf OpenFOAM-1.4.General.gtgze controlliamo se possiamo proseguire con l'installazione tramite il comando:
tar -xzf OpenFOAM-1.4.linuxGcc4SPOpt.gtgz
tar -xzf OpenFOAM-1.4.linuxGcc4DPOpt.gtgz~/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4/bin/foamSystemCheckEffettiuamo la modifica al file ~/.bashrc dando:nano ~/.bashrce aggiungendo al termine del file la seguente riga:. $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4/.OpenFOAM-1.4/bashrcSalviamo premendo contemporaneamente i tasti CRTL+O e usciamo con CTRL+XL'operazione successiva prevede la realizzazione della cartella per l'utente che dovrà utilizzare i programmi di simulazione e:mkdir -p ~/OpenFOAM/${LOGNAME}-1.4/rune la successiva copia dei file di esempio:cp -r ~/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4/tutorials ~/OpenFOAM/${LOGNAME}-1.4/runOra usciamo dalla connessione ssh e rientriamo per permettere di ricarica re il file ~/.bashrc, quindi diamo:exitPer controlare se tutto è andato a buon fine possiamo lanciare la simulazione di esempio presente nei tutorial:
ssh simulation@localhostcd ~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorials/icoFOAM/Se tutto termina con successo l'installazione di base è terminata, ma è necessario installare altri programmi per poter effettivamente trarre utilità dei programmi finora installati; in particolare sono necessari paraFoam per la visualizzazione dei risultati, Java per poter usare FoamX come interfaccia grafica e il compilatore gcc per la compilazione di nuovi risolutori.
blockMesh . cavity
icoFoam . cavity
Per l'installazione del visualizzatore grafico è necessario creare una nuova cartella e posizionarvici all'interno:mkdir ~/OpenFOAM/linuxOra si deve scaricare il pacchetto contente i binari:
cd ~/OpenFOAM/linuxwget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/paraview-2.4.4.linux.tgze la successiva decompressione:tar -xzf paraview-2.4.4.linux.tgzA questo punto l'applicativo è stato installato.
Un operazione simile a quella necessari aper ParaView è necessaria er l'installazione di Java, quindi entriamo nella cartella precedentemente realizzata, scarichiamo il file e decomprimiamolo:cd ~/OpenFOAM/linuxAnceh in questo caso l'installazione di Java è terminata.
wget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/j2sdk1.4.2_05.linux.tgz
tar -xzf j2sdk1.4.2_05.linux.tgz
Come visto precedentemente diamo i comandi:cd ~/OpenFOAM/linux
wget http://mesh.dl.sourceforge.net/sourceforge/foam/gcc-4.1.2.linux.tgz
tar -xzf gcc-4.1.2.linux.tgz
Al termine dell'installazione di tutti i programmi necessari usciamo e riconnettiamoci tramite ssh, ricordandoci di passare l'ozione -X, necessaria a poter lanciare applicazioni grafiche, quindi:exitPer controlare che tutto funzioni diamo il comando:
ssh -X simulation@localhostfoamInstallationTestche dovrebbe confermarci che tutto funziona correttamente.
Possiamo ora visualizzare i risultati della simulazione risolta precedentemente:cd ~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorial/icoFoam/A questo punto possiamo dedicarci al nostro lavoro o passare alla compilazione di tutti gli applicativi per l'ottimizzazione rispetto all'arhchitettura della nostra macchina.
paraFoam . cavity
Comments
blockMesh
Hi,
I am using OpenFoam 1.4 (on Suse-10.2) and I have a problem with
blockMesh . cavity
The error message is:bash: blockMesh: command not found
It worked before, but suddenly it stopped working.Could please someone give me a hint where I should look to fix the problem?
Thank you for the help,
Rita
check if your .bashrc call
check if your .bashrc call openFOAM basrc for adding OF Folder into path.
Have you got some command for compilate blockmesh (wmake all or similar)?
please chech if blockMesh is aviable into your system:
find blockMesh
ByeGenerazione chiavi
ciao Mavimo, sto provando ad installare openfoam 1.4 sulla versione 7.10 di ubuntu ma mi ma il seguente errore quando voglio generare le chiavi:
ignazio@ignazio-desktop:~$ ssh-keygen -t dsati prego aiutami, sono un giovane ingegnere che si sta appassionando alla CFD...ciao e grazieGenerating public/private dsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/ignazio/.ssh/id_dsa): /id_dsa
Enter passphrase (empty for no passphrase):
Enter same passphrase again:
open /id_dsa failed: Permission denied.
Saving the key failed: /id_dsa.
Problemi OpenFoam 1.4.1 64
Ciao, volevo chiederti se potevi aiutarmi a configurare Openfoam,il mio sitema è Ubuntu 8.04 a 64 bit.
I problemi che ho sono:
Software versions-------------------------------------------------------------------------------
Software Version Location
-------------------------------------------------------------------------------
gcc 4.2.3
WARNING: Conflicting installations:
foam settings: /home/simulation/OpenFOAM/linux/gcc-4.2.1-64/bin/gcc
current path : /usr/bin/gcc
CRITICAL ERROR
java 1.6
WARNING: Conflicting installations:
foam settings: /home/simulation/OpenFOAM/linux/j2sdk1.4.2_05/bin/java
current path : /usr/bin/java
gzip 1.3.12 /usr/bin/gzip
tar 1.3.12 /bin/tar
icoFoam *** not installed ***
CRITICAL ERROR
Ho letto un pò nei forum e come prima cosa mi hanno detto di modificare il file .bashrc, aggiungendo la stringa:
export WM_64=one poi di chiamare la cartella dove vanno java,gcc e paraview non "linux" ma bensì "linux64".Nonostante io abbia apportato queste modifiche il problema persiste.
Spero che tu mi possa aiutare . Grazie
Innanzitutto se ti da
Innanzitutto se ti da conflitto di installazione è perchè nel tuo sistema è già installato il GCCe Java, quindi lo trova due volte (uno nel path di default e uno nel path specificato da OpenFOAM), di conseguenza puoi scegeliere di disinstallare quelle del sistema o quello di OpenFOAM, e modificare i path inclusi in modo da rimuovere i conflitti.
Fatta questa prima operazione non trova icoFoam, quindi probabilmente non hai installato correttamente tutti i file del sistema, o hai installato i pacchetti non compilati e devi andare a comilarli, per ware questo dovrebbbe essereci un comando che si chiama wmakeAll nella cartella di OpenFOAM, in ogni caso prima risolvi la prima parte (conflitto del GCC e JAVA) e poi vediamo di risolvere la seconda.
Mavimo
PS: il tuo sistema operativo è a 64bit?
Ciao, ti ringrazio
Ciao, ti ringrazio anticipatamente per la repentina risposta.
Ho già provato a disistallare sia java che gcc e il risultato è lo stesso anzi così non trova proprio nulla. Come si fa per modificare il Path di Openfoam? Poi ho anche provato la compilazione lanciando wmakeall e mi dice tutto ok, solo che poi rilacnio il tester per l'istallazione e mi ridà i soliti errori.
Il mio sistema è Ubuntu 8.04 64 bit (kernel 2.26.24-19).
Giuseppe
Problemi con l'installazione di OpenFOAM
Ciao.
Dunque, avrei un paio di domande da farti circa l'installazione di OpenFOAM su Ubuntu.
sammy@SamIam:~$ sudo apt-get install libssl0.9.7Riesci a trovare una soluzione a ciò?Lettura della lista dei pacchetti in corso... Fatto
Generazione dell'albero delle dipendenze in corso
Reading state information... Fatto
E: Impossibile trovare libssl0.9.7
vostro_utente@localhostalla luce dello script che ti ho copiato sopra, devo mettere "sammy@SamIam", giusto?sammy@SamIam:~$ su simulationIn questo caso cosa devo fare?Password:
simulation@SamIam:/home/sammy$ ssh-keygen -t dsa
Generating public/private dsa key pair.
Enter file in which to save the key (/home/simulation/.ssh/id_dsa): prova
Enter passphrase (empty for no passphrase):
Enter same passphrase again:
open prova failed: Permission denied.
Saving the key failed: prova.
Come suggeriscono in questo post dare il comando "ssh-keygen -t dsa" dal vecchio utente e non dal nuovo?
Corretto?
Grazie mille,
Samuele.
Ps: è un problema risp via email? Comunque, tengo controllato anche questo blog. Grazie.
Pps: sai mica come installare gpiv su ubuntu e, soprattutto, come farlo funzionare?
Grazie ancora.
Samuele.
Non trovi le librerie di
apt-cache search libssle vediamo se le trova. Per poter avere la possibilità di installarlo devi avere APT correttament einstallato e confgurato per usare i repository main e universe (bastano questi se non ricordo male).Ciao
Mavimo
PS: invio anche per mail.
sammy@SamIam:~$ apt-cache
sammy@SamIam:~$ apt-cache search libssl
cl-plus-ssl - A simple Common Lisp interface to OpenSSL
dcmtk - The OFFIS DICOM toolkit command line utilities
libdcmtk1 - The OFFIS DICOM toolkit runtime libraries
libdcmtk1-dev - The OFFIS DICOM toolkit development libraries and headers
libssl-ocaml - OCaml bindings for OpenSSL
libssl-ocaml-dev - OCaml bindings for OpenSSL
libssl-dev - SSL development libraries, header files and documentation
libssl0.9.8 - SSL shared libraries
libssl0.9.8-dbg - Symbol tables for libssl and libcrypto
Quindi devo dargli: apt-get install libssl?
Giusto?
Grazie mille,
Samuele
Open FOAM
Hello,
I'm a brasilian and i don't understand none word in italian,but i noticed that the discusion is about problems with OpeanFOAM in version 64bits! I made everthing that you said and i had problems wiht the blockMesh too! So, i made in the sequence (after read your instrutions):
sudo slocate -uslocate blockMesh
and "appeared things" in the screen (i belive that this "things" are the same "things" that should had appeared if we call the blockMesh). After this i don't undestand anything! Could you help me? Please! I'm a beginner in linux! Sorry by my terrible english! i'm learning too!!! Thank you !
William Clem
Hi William,
you have execute the installation from scretch (source) or binary? Probably you don't have execute the correct installation process or into biray pack there isn't all binary file. Please execute a new installation procedure and execute step-by-step guide. If you have any problem contact me and (if possible) I help you to complete 64bit installation.
PS: you must also excuse me for my bad english ;)
Hello, My boss told me
Hello,
My boss told me what is the probable problem! I had installed a linux UBUTUN version for plataform 32 bits so...when i tried to install the OpenFOAM 64 bits the program didn't load! they aren't compatible!!!! Sorry for make you lost time with this!!! Thank very much indeed!!!
william clem
BlockMesh
Ciao Mavimo, ho seguito le tue istrustioni per istallare OpenFOAM 1.4.1 con piattaforma 64bit, ed al momento di lanciare l'applicazione trovo l'errore da più riportato su blockMesh non trovato. Allora ho provato a digitare i comandi sudo slocate -u e slocate blockMesh e dopo quest'ultimo mi compaionot tutti i blockMeshDict contenuti nei tutorials contenuti a loro volta nella cartella OpenFOAM-1.4.1 e non in simulation-1.4.1 come immagino dovrebbe essere..per esempio:
/home/simulation/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4.1/tutorials/twoPhaseEulerFoam/bubbleColumn/constant/polyMesh/blockMeshDicte così per tutti i tutorials/home/simulation/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4.1/tutorials/twoPhaseEulerFoam/bed/constant/polyMesh/blockMeshDict
ed inoltre compaiono i seguenti, di cui ne riporto solo due, che sono i contenuti della cartella mesh:
/home/simulation/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4.1/applications/utilities/mesh/generation/blockMesh/curvedEdgespoi se digito/home/simulation/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4.1/applications/utilities/mesh/generation/blockMesh/curvedEdges/BSpline.H
ls -l /path/di/blockMeshrisponde nessun file o directoryGrazie anticipatamente
Ciao Mattia
pare che qualche cosa non sia a posto, in particolare sembra che no trovi il file blockMesh (ma a questo punto giurerei che non trova nemmeno gli altri eseguibili). I problemi che possono causare questo sono i path aggiunti al .basrc, che non sono stati caricati correttamente, oppure non hai caricato i binari dell'installazione ma solo i sorgenti. Sinceramente non ho mai provato con i 64bit, quindi non so esattamente dove potrebbe essere il problema (e sinceramente non ho nemmeno mai installato la 1.4.1, ma non credo cambi molto dalla 1.4), tra poco installo Gusty e OpenFOAM 1.4.1 e vedo se è cambiato qualche cosa.
Intanto prova a rifare l'installazione dopo aver rimosso tutto (e anche l'utente che ricreerai da 0) seguendo le indicazioni passo passo, nel caso di errori prova a dire cosa succede, ma prova a dare
slocate blockMes | grep bine vediamo cosa risponde...Complimenti
Grande articolo!
Ho installato tutto in tempo di record e sembra funzionante.
Avevo provato a far funzionare su di un'altra macchina la versione Cygwin di openFoam e mi e' costato una settimana di prove senza
riuscire a far funzionare paraView.
Grazie
Grazie!
comunque cercar di far funzionare OpenFOAM su win con cygwin non è proprio una cosa semplice :)
PS: se quello del forum, vero? Come ci si trova al gathec? Come hai fatto ad entrare? Posso farti qualche domanda in privato? La mia mail è valida (leggi nel footer), fammi sapere :)
Ciao Mavimo, complimenti per
Ciao Mavimo,
complimenti per la guida molto chiara ed esaustiva!
Due cose:
ParaView error: InitializeTcl failedTk_Init error: no display name and no $DISPLAY environment variable
Ciao M.
Risolto il problema della
Risolto il problema della visualizzazione del server grafico con X11:
basta de-commentare l'opzione
ForwardX11 yesnel file /etc/ssh/ssh_configCiao M.
Ciao,
Ciao,
Sembra tutto corretto, i permesi su blockMesh:
drwxr-xr-x 5 simulation simulation 4096 2007-05-29 23:37 blockMeshdrwxr-xr-x 5 simulation simulation 4096 2007-05-29 23:37 extrudeMesh
Quando faccio [Tab], dall'utente simulation mi il seguente risultato, e se riprovo il blockMesh non lo va ancora.
foam foamDistccd foamGraphResUVWP foamNew foamPackBin foamProcessInfoUn'osservazione:foamAllHC foamEndJob foamInstallationTest foamNewRootCase foamPackBinAll foamSolverSweeps
foamCheckJobs foamfv foamJob foamNewRootCaseAll foamPackGeneral foamsrc
foamCleanPath foamGraphExecTime foamLog foamNewRootCaseAllCases foamPackSource foamSystemCheck
foamClearPolyMesh foamGraphResKE foamLog.db foamPack foamPrintJobs
simulation@Pc2:~$ cd ~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorials/icoFoam
simulation@Pc2:~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorials/icoFoam$ blockMesh . cavity
-bash: blockMesh: command not found
simulation@Pc2:~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorials/icoFoam$
come vedi dagli ultimi comandi per andare a icofoam, io per trovare qualcosa devo scrivere icoFoam e non icoFOAM. E' possibile?
Non ti ho detto che sto usando la versione a 64 bit...
Grazie ancora.
Ok, il file c'è ed è
Ok, il file c'è ed è corretto, gli altri file di OpenFOAM pare che li trovi, quindi non è problema di path (almeno mi pare), per stare sicuro mi potresti mandare (anche per mail) il file ~/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4/.OpenFOAM-1.4/bashrc che provo a confrontarlo con la mia installazione a 32bit. Prova a lanciare l'applicazione con il percorso completo e vedi se almeno così funziona.
Ciao
PS: Stai trovando tutti gli errori che avevo commesso nella guida, grazie ;)
Ciao,
Ciao,
ho installato OpenFOAM su kubuntu 7.04. Va tutto a buon fine ma quando faccio la simulazione di prova, dice che il comando blockMesh non esiste.
Ho i seguenti dubbi:
La riga della tua guida ~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorial/icoFOAM/ è corretta? Tutorial, non tutorials?
La fine del file del mio file di .bashc è corretta?
# enable programmable completion features (you don't need to enableNella sequenza di comandi in cui compare LOGNAME, devo solo cambiare LOGNAME con il mio nome utente? non con simulation, vero? Tutto il resto rimane invariato?# this, if it's already enabled in /etc/bash.bashrc and /etc/profile
# sources /etc/bash.bashrc).
if [ -f /etc/bash_completion ]; then
. /etc/bash_completion
fi
. $HOME/OpenFOAM/OpenFOAM-1.4/.OpenFOAM-1.4/bashrc
Ti riporto la riga con il messaggio che compare quando richiamo blockMesh:
simulation@Pc2:~/OpenFOAM/simulation-1.4/run/tutorials/icoFoam$ blockMesh . cavity-bash: blockMesh: command not found
Ti ringrazio anticipatamente.
Saluti.
Ciao
il bashrc mi pare corretto (ora non posso controllare, ma a memoria mi pare vada bene). dove compare LOGNAME lascialo pure così, ovvero con ${LOGNAME}, si tratta del tuo nome che è salvato come variabile, quindi vien convertito automaticamente nel tuo nome, se vuoi scrivere il tuo nome è uguale.. semplicemente è un passaggio che puoi evitare.
Per quanto riguarda il fatto della cartella tutorials hai perfettamente ragione, grazie per la segnalazione, provvedo a correggere immediatamente.
Per quanto riguarda il fatto che non trovi blockMesh hai provato a ricaricare il .bashrc (disconnetterti e riconnetterti come utente) in modo che setti tutte le variabili correttamente? Se anche così non dovesse cambiare prova a dare i comandi:
sudo slocate -ue postane l'output, dovrebbe dirti in quale directory si trova blockMesh, a questo punto controlla che abbia i corretti permessislocate blockMesh
ls -l /bath/di/blockMeshe se anche questi sono settati correttamente prova a vedere quando da terminale daifoam [TAB][TAB]dove ovviamente i [TAB] sono i caratteri di tabulazione. In questo modo vediamo se manca solo il blockMesh, e quindi si tratta di un problema ristretto a questo specifico programma o se è un problema più generale (non trova nemmeno gli altri eseguibili di OpenFOAM) e quindi il problema stà nel settare correttamente il PATH.Post new comment